Cuenta la historia que el nombre del Parque Nacional se debe a un Cacique que comando a su pueblo en la resistencia contra la invasión española. Grupo humano que tal vez formó parte de la gran nación Guaraní. Pueblo que resistió permanentemente, y que aún hoy continúa su resistencia por hacer valer su cultura, sus tierras, la naturaleza arrasada… “Calilegua” al encontrarse acorralado, subió a una de las montañas, y desde allí se arrojó para no ser esclavo del invasor. Dicen los ancianos que su espíritu corre libre por la selva, junto al “Yagua” (nombre guaraní del Yaguareté).
Como ironía del destino, el departamento de Ledesma, lleva el nombre de uno de los adelantados españoles que conquistaron aquella zona del ramal jujeño. Dentro de ese departamento se hallan, el Parque Nacional, un pueblo (sede de la intendencia del parque), el mítico cerro y toda la serranía, todos ellos llevan el nombre de Calilegua, símbolos quizás, de resistencia de una cultura, de la naturaleza…